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Les macrophages pulmonaires effectuent le plus grand voyage de leur vie peu après la naissance : ils migrent du foie au poumon dans les 3 premiers jours suivant la naissance. Une personne inhale plus de 10 000 litres d’air par jour. Les poumons sont constamment exposés à des particules étrangères et à des agents pathogènes provenant de l’environnement extérieur. Les macrophages résidant dans les tissus pulmonaires jouent un rôle majeur dans la filtration de l'air inhalé et dans le maintien de l'homéostasie des tissus, afin de protéger l'hôte des agents pathogènes aéroportés. Nos poumons abritent deux populations principales de macrophages résidant dans les tissus et dotés de fonctions spécialisées basées sur leur compartiment anatomique. Les macrophages alvéolaires se trouvent dans l'alvéole, tandis que les macrophages interstitiels se trouvent dans les tissus environnants l"alvéole. Les macrophages situés dans les voies respiratoires supérieures ont été proposés comme troisième population mais sont généralement regroupés avec les macrophages pulmonaires. Les macrophages alvéolaires sont mieux connus que les macrophages interstitielles car ils sont plus accessibles par lavage broncho-alvéolaire.
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