OrthoDB

OrthoDB est un catalogue de gènes codant des protéines orthologues à travers les vertébrés, les arthropodes, les fungi, et les bactéries. L'orthologie fait référence au dernier ancêtre commun d'un ensemble d'espèces considérées, et donc OrthoDB définie explicitement les orthologues à chaque point de rayonnement le long de la phylogénie des espèces. La base de données OrthoDB fourni des descripteurs de protéines, ainsi que les attributs GO et InterPro, qui servent à fournir des annotations descriptives générales des groupes orthologues et faciliter l'interrogation de base de données de orthologie. OrthoDB fournit également des traits évolutifs d'orthologues calculés, comme les duplications et les profils de perte, les taux de divergence, et des familles, qui sont maintenant étendus pour inclure les détails d'architecture d'intron-exon, orthologues de synténie, et les arbres parent-enfant.

Texte : extrait de l'article Wikipédia « OrthoDB », sous licence CC BY-SA 4.0.