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En génétique des populations, la sélection directionnelle est un mode de sélection naturelle où les individus présentant un caractère à une extrémité de la distribution phénotypique ont une meilleure valeur sélective que les individus présentant des phénotypes intermédiaires ou extrêmes opposés. Au fil du temps, les fréquences alléliques, et par conséquent la moyenne de la population pour ce caractère, évoluent de façon constante vers le phénotype extrême associé à la meilleure valeur sélective. L'évolution de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries en est un exemple : l'introduction d'une forte pression de sélection (l'antibiotique) sélectionne les souches bactériennes résistantes, déplaçant ainsi les fréquences alléliques vers les phénotypes présentant une forte résistance à l'antibiotique.
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